110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3835 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  100 
 
 
169 aa  342  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  72.78 
 
 
169 aa  265  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  73.37 
 
 
169 aa  251  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  66.86 
 
 
169 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  64.46 
 
 
169 aa  240  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  64.46 
 
 
169 aa  240  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  69.28 
 
 
169 aa  236  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  66.86 
 
 
169 aa  228  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  50.29 
 
 
174 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  49.71 
 
 
174 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  54.49 
 
 
161 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  52.69 
 
 
161 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  52.41 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  53.29 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  53.29 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  55.84 
 
 
162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  52.41 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  55.48 
 
 
161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  48.19 
 
 
162 aa  160  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  48.19 
 
 
162 aa  160  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  50 
 
 
173 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  46.27 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  43.71 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  46.32 
 
 
172 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  46.32 
 
 
172 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  47.06 
 
 
172 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  45.59 
 
 
172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  47.06 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  41.72 
 
 
172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  46.27 
 
 
173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  46.27 
 
 
173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  45.52 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  42.96 
 
 
179 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  37.5 
 
 
161 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  34.78 
 
 
161 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  38.18 
 
 
161 aa  111  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  37.5 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  34.16 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  36.2 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  36.2 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  36.02 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  46.43 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  36.59 
 
 
161 aa  107  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  39.26 
 
 
178 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  40.44 
 
 
184 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  39.26 
 
 
193 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  34.94 
 
 
172 aa  105  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  35.33 
 
 
172 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  37.78 
 
 
181 aa  104  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  38.52 
 
 
179 aa  103  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  40 
 
 
184 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  33.52 
 
 
182 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  39.42 
 
 
184 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  35.19 
 
 
161 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  38.52 
 
 
177 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  32.52 
 
 
161 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  36.3 
 
 
182 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  36.3 
 
 
182 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  35.85 
 
 
163 aa  97.4  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  34.38 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  44.34 
 
 
132 aa  95.5  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  33.83 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  33.83 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  30.86 
 
 
161 aa  94.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  32.73 
 
 
161 aa  94  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  32.08 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  30.86 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  33.09 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  27.5 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  27.61 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  28.48 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  27.88 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  33.33 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  33.33 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  33.33 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  33.6 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  28.16 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  27.12 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  29.63 
 
 
164 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  29.27 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  27.14 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  27.18 
 
 
170 aa  61.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  31.62 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  31.62 
 
 
163 aa  61.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  26.79 
 
 
175 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  25.45 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  32.48 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  31.86 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  28.99 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  29.03 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  25.45 
 
 
155 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  25.45 
 
 
155 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  25.45 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  30.16 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  29.84 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  29.37 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  28.21 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  37.17 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  37.17 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  31.62 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>