111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0326 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 161 aa  320  4e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  87.58 
 
 		 161 aa  293  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  88.75 
 
 		 162 aa  291  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  89.44 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  88.82 
 
 		 161 aa  290  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  86.34 
 
 		 161 aa  286  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  86.34 
 
 		 161 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  86.34 
 
 		 161 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  84.38 
 
 		 162 aa  279  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  84.38 
 
 		 162 aa  278  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  57.14 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  59.86 
 
 		 169 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  54.78 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  54.78 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  55.48 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  57.04 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  57.64 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  52.86 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  54.17 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  48.59 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  43.66 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  41.72 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  44 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  39.22 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  37.74 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  40.99 
 
 		 182 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  41.45 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  41.33 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  40.26 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  40.26 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  42.25 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  42.96 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  39.02 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  39.02 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  36.99 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  38.99 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  37.95 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  42.96 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  40.85 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  39.22 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  36.75 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  42.66 
 
 		 184 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  40.4 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  40.4 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  40.56 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  40.56 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  36.48 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  38.75 
 
 		 161 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  37.66 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  37.66 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  38.16 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  38.56 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  39.24 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  40.52 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  40.14 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  37.74 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  35.67 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  40.56 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  36.71 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  35.22 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  37.25 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  34.38 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  39.1 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  35.53 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  34.69 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  33.56 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  28.75 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  30.49 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  27.39 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  31.33 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  29.7 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  28.66 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  31.9 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  30.91 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  27.44 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  29.91 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  33.54 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  33.54 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  30.53 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  27.61 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  29.7 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  28.92 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  28.92 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  31.3 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  30.12 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  28.57 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  28.31 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  26.38 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  26.38 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  29.91 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  25.38 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  27.88 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  29.06 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  27.13 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  28.4 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  29.09 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  29.09 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  29.09 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  28.57 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>