99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0996 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  100 
 
 
164 aa  339  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  87.8 
 
 
164 aa  280  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  85.37 
 
 
164 aa  271  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  71.34 
 
 
164 aa  229  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  68.9 
 
 
164 aa  221  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  63.1 
 
 
165 aa  206  9e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  64.63 
 
 
162 aa  194  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  63.1 
 
 
165 aa  185  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  57.32 
 
 
155 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  57.32 
 
 
155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  57.32 
 
 
155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  56.1 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  41.57 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  40.96 
 
 
162 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  43.71 
 
 
162 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  41.76 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  41.57 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  38.55 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  36.75 
 
 
162 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  38.55 
 
 
162 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  40.36 
 
 
162 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  35.76 
 
 
163 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  38.79 
 
 
163 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  38.79 
 
 
163 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  36.75 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  36.75 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  34.25 
 
 
306 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  31.06 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  31.06 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  30.43 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  29.01 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  28.83 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  28.83 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  29.19 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  29.01 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  29.81 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  26.99 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  28.4 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  30.06 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  27.16 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  29.27 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  30.53 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  28.22 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  28.66 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  27.39 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  28.83 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  26.47 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  28.05 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  28.89 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  25.61 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  26.54 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  25.61 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  26.38 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  29.37 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  29.71 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  26.83 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  28.24 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  29.41 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  27.48 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  26.87 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  27.48 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  32 
 
 
179 aa  60.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  29.17 
 
 
173 aa  60.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  26.92 
 
 
163 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  25.61 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  25.61 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  26.12 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  27.2 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  30.33 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  25 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  27.56 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  27.56 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  24.39 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  27.2 
 
 
172 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  27.2 
 
 
172 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  28 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  28 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  24.19 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  27.94 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  25.6 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  27.69 
 
 
182 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  27.69 
 
 
182 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  32.53 
 
 
132 aa  51.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  22.14 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  23.7 
 
 
181 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  24.58 
 
 
173 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  26.4 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  27.91 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  24.4 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  29.23 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  21.38 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  26.61 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  20.5 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  24.29 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0356  glutaredoxin  30.88 
 
 
427 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.655994  normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  21.85 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  26.47 
 
 
170 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  26.47 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  26.47 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>