101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5732 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  100 
 
 		 164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  85.37 
 
 		 164 aa  272  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  86.59 
 
 		 164 aa  270  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  71.34 
 
 		 164 aa  219  9e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  69.51 
 
 		 164 aa  214  5e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  61.9 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  63.1 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  64.02 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  59.15 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  57.93 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  57.93 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  57.32 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  43.37 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  42.17 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  43.98 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  44.31 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  42.94 
 
 		 163 aa  124  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  40.96 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  40.36 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  39.76 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  42.17 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  38.18 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  40.96 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  40.96 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  42.42 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  42.42 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  38.26 
 
 		 306 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  32.72 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  32.72 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  32.92 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  31.48 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  30.86 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  31.48 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  31.29 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  30.25 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  29.01 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  30.06 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  30.06 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  29.01 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  28.4 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  29.01 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  30.67 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  29.01 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  30.37 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  27.44 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  29.45 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  26.22 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  32.35 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  29.77 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  32.12 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  36.09 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  30.37 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  27.44 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  27.44 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  28.14 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  30.16 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  25.77 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  27.54 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  28.24 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  26.52 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  25.76 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  24.54 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  23.93 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  28.15 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  28.15 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  24.39 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  29.17 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  25 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  26.98 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  28.68 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  26.52 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  26.52 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  27.78 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  27.78 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  29.51 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  27.94 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  29.63 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  36.14 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  26.98 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  24.39 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  28 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  29.27 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  26.4 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  22.9 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  25.93 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  25.93 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  28.8 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  29.92 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  24.18 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  26.32 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  29.6 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  26.24 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  27.13 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  20.62 
 
 		 194 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  29.13 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  29.13 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  22.37 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  28.16 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  24.58 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0356  glutaredoxin  30.66 
 
 		 427 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.655994  normal  0.103709 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>