112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1133 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  92.07 
 
 		 164 aa  316  7e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  62.96 
 
 		 163 aa  238  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  60 
 
 		 161 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  60 
 
 		 161 aa  220  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  60.62 
 
 		 161 aa  219  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  60.62 
 
 		 161 aa  219  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  58.75 
 
 		 161 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  57.5 
 
 		 161 aa  211  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  58.59 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  46.58 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  42.86 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  41.88 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  43.75 
 
 		 161 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  42.04 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  40.76 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  42.24 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  41.25 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  40.99 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  40.99 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  37.41 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  37.41 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  36.5 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  35.66 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  34.81 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  34.97 
 
 		 173 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  35.25 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  35.25 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  36.77 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  33.54 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  38.93 
 
 		 169 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  35.04 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  33.54 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  35 
 
 		 169 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  35 
 
 		 169 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  32.4 
 
 		 179 aa  97.1  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  33.09 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  32.91 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  32.28 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  33.54 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  33.58 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  37.12 
 
 		 169 aa  94  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  32.7 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  32.08 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  32.08 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  32.08 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  32.08 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  32.08 
 
 		 172 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  32.54 
 
 		 193 aa  91.3  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  33.56 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  32.9 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  32.45 
 
 		 174 aa  90.5  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  36.17 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  31.13 
 
 		 192 aa  88.2  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  29.71 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  34.67 
 
 		 169 aa  87  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  32.9 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  30 
 
 		 179 aa  84.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 169 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  29.8 
 
 		 174 aa  84  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  29.03 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  30.53 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  32.52 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  27.74 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  30.16 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  32.33 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  31.78 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  31.01 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  25.93 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  25.93 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  29.63 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  27.95 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  27.33 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  25.79 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  29.01 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  25.16 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  28.99 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  25.74 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  25.48 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  27.61 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  29.75 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  29.75 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  26.11 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  24.84 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  23.27 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  24.84 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  26.54 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  24.84 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  25.16 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  21.3 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  21.24 
 
 		 702 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  28.8 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  26.11 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  26.11 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  25.11 
 
 		 1132 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  25.52 
 
 		 913 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  20.45 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  23.88 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  23.49 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  23.88 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>