94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4516 on replicon NC_011723
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  71.51 
 
 		 184 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  68.28 
 
 		 184 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  68.82 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  67.2 
 
 		 184 aa  247  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  60.22 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  61.29 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  61.29 
 
 		 193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  56.45 
 
 		 182 aa  208  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  58.06 
 
 		 179 aa  205  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  61.18 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  56.22 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  56.22 
 
 		 182 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  47.31 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  50.27 
 
 		 173 aa  168  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  51.4 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  48.04 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  48.04 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  50 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  51.67 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  47.31 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  47.78 
 
 		 172 aa  160  7e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  47.78 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  47.78 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  47.22 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  46.99 
 
 		 172 aa  157  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  41.67 
 
 		 172 aa  140  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  45.77 
 
 		 161 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  52.21 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  45.07 
 
 		 161 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  38.76 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  45.93 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  35 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  45.07 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  45.07 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  45.86 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  42.96 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  43.66 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  37.22 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  48.74 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  50 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  36.47 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  48.67 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  44.44 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  40.97 
 
 		 169 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  40.97 
 
 		 169 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  46.43 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  52.68 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  45.59 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  37.69 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  40.54 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  28.89 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  28.73 
 
 		 161 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  28.73 
 
 		 161 aa  84.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  27.22 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  28.18 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  28.18 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  28.18 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  28.18 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  32.52 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  27.22 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  30.33 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  26.52 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  26.52 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  25.41 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  29.85 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  29.27 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  29.19 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  27.07 
 
 		 161 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  29.23 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  28.21 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  28.42 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  21.48 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  26.43 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  25.54 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  39.19 
 
 		 705 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  25.66 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  29.55 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  25.79 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  35.59 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  25.32 
 
 		 155 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  22.73 
 
 		 702 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  23.53 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  25.18 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  26.43 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  26.43 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  28.24 
 
 		 913 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  28.44 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  34.43 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  27.91 
 
 		 1100 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  27.72 
 
 		 163 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  26.32 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  30.16 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  23.7 
 
 		 155 aa  41.2  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>