94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03321 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  100 
 
 
182 aa  366  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  86.19 
 
 
182 aa  325  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  85.64 
 
 
182 aa  323  7e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  78.57 
 
 
181 aa  293  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  65.78 
 
 
184 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  65.95 
 
 
184 aa  245  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  65.41 
 
 
184 aa  245  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  64.29 
 
 
177 aa  237  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  62.64 
 
 
193 aa  225  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  60.44 
 
 
178 aa  221  6e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  59.89 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  56.45 
 
 
184 aa  208  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  55.43 
 
 
179 aa  191  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  48.9 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  47.25 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  47.25 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  49.72 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  46.96 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  46.96 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  48.35 
 
 
172 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  47.8 
 
 
173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  44.89 
 
 
172 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  44.89 
 
 
172 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  47.25 
 
 
172 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  47.43 
 
 
173 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  45.86 
 
 
172 aa  150  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  44.32 
 
 
172 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  40.57 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  39.08 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  39.77 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  40.99 
 
 
170 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  42.86 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  43.56 
 
 
162 aa  124  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  42.94 
 
 
162 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  42.68 
 
 
161 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  42.68 
 
 
161 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  41.51 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  41.61 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  42.86 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  40.99 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  41.61 
 
 
161 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  42.22 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  41.48 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  42.96 
 
 
169 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  42.96 
 
 
169 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  41.48 
 
 
169 aa  104  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  33.52 
 
 
169 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  40.74 
 
 
169 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  38.06 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  42.36 
 
 
169 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  38.81 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  28.81 
 
 
161 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  28.25 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  28.25 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  27.62 
 
 
161 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  26.55 
 
 
161 aa  82  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  27.68 
 
 
161 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  26.55 
 
 
161 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  28.25 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  27.12 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  26.55 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  26.7 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  26.55 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  30.16 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  25.99 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  25.99 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  25.99 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  28.19 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  27.78 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  29.05 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  25.42 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  27.17 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  27.37 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  21.8 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  25.71 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  26.63 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  26.67 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  27.94 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  27.72 
 
 
162 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  27.42 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  27.56 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  24.19 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  27.57 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  20 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  29.63 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  38.57 
 
 
195 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  25 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  23.61 
 
 
192 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  30.77 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  24.86 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  27.42 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  34.29 
 
 
702 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  27.62 
 
 
163 aa  40.8  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  27.62 
 
 
163 aa  40.8  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.348249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>