68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1880 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  50.8 
 
 		 191 aa  197  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  36.22 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  35.68 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  34.07 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  31.01 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  33.09 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  27.74 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  29.93 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  31.09 
 
 		 169 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  28.23 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  26.67 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  24.41 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  25.93 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  28.93 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  26.52 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  23.65 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  23.65 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  25.37 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  26.4 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  27.84 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  27.41 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  25 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  25.64 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  26.36 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  24.81 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  25 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  26.36 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  26.67 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  26.36 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  26.19 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  26.19 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  26.8 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  25.58 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  25.58 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  24.6 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  24.63 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  27.42 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  27.42 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  29.47 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  26.21 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  28.42 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  27.37 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  27.37 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  29.31 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  27.55 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  25.19 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  25.71 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  25.77 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  25.21 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  25.26 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  25.97 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  25.81 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  25.77 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  27.71 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  21.25 
 
 		 164 aa  48.9  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  25.36 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  25 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  21.83 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  23.08 
 
 		 132 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  24.8 
 
 		 179 aa  44.7  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  21.8 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  24.53 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  21.37 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  21.88 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  28.57 
 
 		 161 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  28.57 
 
 		 161 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  20.77 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>