96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0997 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  100 
 
 
179 aa  362  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  88.46 
 
 
177 aa  282  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  73.29 
 
 
184 aa  235  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  66.1 
 
 
184 aa  230  9e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  67.44 
 
 
179 aa  229  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  62.37 
 
 
184 aa  228  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  64.91 
 
 
193 aa  215  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  63.53 
 
 
178 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  61.18 
 
 
184 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  58.05 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  57.47 
 
 
182 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  57.8 
 
 
181 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  55.43 
 
 
182 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  54.02 
 
 
173 aa  182  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  53.76 
 
 
173 aa  178  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  52.6 
 
 
172 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  52.6 
 
 
172 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  52.02 
 
 
173 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  52.02 
 
 
173 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  50.29 
 
 
172 aa  174  7e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  49.71 
 
 
172 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  51.15 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  49.13 
 
 
172 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  48.88 
 
 
172 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  45.81 
 
 
173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  42.7 
 
 
172 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  40.45 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  43.31 
 
 
170 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  42.68 
 
 
170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  42.04 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  41.45 
 
 
175 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  43.38 
 
 
169 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  38.27 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  41.72 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  40.52 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  37.65 
 
 
161 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  39.6 
 
 
161 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  38.93 
 
 
162 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  39.22 
 
 
161 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  41.54 
 
 
174 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  37.42 
 
 
162 aa  104  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  37.04 
 
 
161 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  37.04 
 
 
161 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  38.52 
 
 
169 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  40.77 
 
 
174 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  36.81 
 
 
162 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  40 
 
 
169 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  40 
 
 
169 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  42.96 
 
 
169 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  32.4 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  38.52 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  32.4 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  32.4 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  30.73 
 
 
161 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  40.74 
 
 
169 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  31.51 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  29.61 
 
 
161 aa  85.9  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  30.17 
 
 
163 aa  85.5  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  33.33 
 
 
161 aa  84.7  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  30.17 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  30.73 
 
 
161 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  28.49 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  29.05 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  29.05 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  31.46 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  29.05 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  30.9 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  28.49 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  28.49 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  28.49 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  29.86 
 
 
132 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  29.03 
 
 
194 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  33.82 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  25 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  36.09 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  24.71 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  25 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  29.69 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  32 
 
 
164 aa  51.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  30.34 
 
 
191 aa  51.2  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  28.57 
 
 
163 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  28.66 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  28.66 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  29.13 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  29.57 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  28.81 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  28.68 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  26.01 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  27.73 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  31.13 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  30.51 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  32.03 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  30.82 
 
 
164 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  25.37 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  27.12 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  27.73 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>