52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0802 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  39.57 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  40.98 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  39.44 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  33.12 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  31.01 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  28.8 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  28.1 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  29.84 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  24.66 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  28.21 
 
 		 161 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  27.45 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  28.21 
 
 		 161 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  28.23 
 
 		 132 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  28 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  25.17 
 
 		 161 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  24.31 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  29.27 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  28.8 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  28.57 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  24.66 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  30 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  26.56 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  28 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  23.84 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  26.49 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  25.83 
 
 		 161 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  25.83 
 
 		 161 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  26.45 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  28.43 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  25.37 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  28 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  25 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  38.57 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  35.71 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  32.26 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  26 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  23.61 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  26 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  33.67 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  26 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  28.28 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  28.28 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  26 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  30.43 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  28.24 
 
 		 169 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  31.18 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  26.67 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  29 
 
 		 169 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  26.32 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  27.38 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>