106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5049 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 172 aa  345  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  79.07 
 
 		 172 aa  283  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  79.07 
 
 		 172 aa  283  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  77.33 
 
 		 172 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  77.33 
 
 		 172 aa  280  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  79.65 
 
 		 172 aa  280  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  76.74 
 
 		 172 aa  276  7e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  75.44 
 
 		 173 aa  274  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  75.44 
 
 		 173 aa  274  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  76.47 
 
 		 173 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  73.26 
 
 		 173 aa  265  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  72.51 
 
 		 173 aa  259  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  63.74 
 
 		 172 aa  232  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  63.37 
 
 		 172 aa  230  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  51.96 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  53.67 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  53.26 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  49.44 
 
 		 178 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  51.15 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  50 
 
 		 193 aa  170  9e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  51.63 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  51.63 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  50 
 
 		 184 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  48.35 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  46.96 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  47.43 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  47.43 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  47.06 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  48.15 
 
 		 169 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  45.81 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  39.31 
 
 		 161 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  43.24 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  43.24 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  38.73 
 
 		 161 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  39.76 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  39.76 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  38.01 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  43.9 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  37.57 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  37.57 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  47.06 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  37.57 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  36.99 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  43.09 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  37.57 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  42.48 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  39.6 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  36.88 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  36.31 
 
 		 161 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  34.91 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  34.73 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  35.8 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  36.25 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  36.25 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  32.34 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  33.58 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  35.66 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  32.93 
 
 		 161 aa  92.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  33.76 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  35.66 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  29.34 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  31.39 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  33.09 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  34.97 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  34.27 
 
 		 170 aa  87.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  28.78 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  28.78 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  29.63 
 
 		 161 aa  84.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  29.63 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  28.99 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  34.55 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  34.04 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  26.35 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  25 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  24.24 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  29.91 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  29.47 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  29.66 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  27.91 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  29.6 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  30.09 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  26.74 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  26.5 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  27.64 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  25.16 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  28 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  26.5 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  28.21 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  26.55 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  28 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  23.62 
 
 		 1100 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  25.76 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  22.73 
 
 		 702 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  27.27 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  23.13 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  43.42 
 
 		 705 aa  44.3  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  23.53 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  30.09 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  30.09 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  22.28 
 
 		 913 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>