91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2872 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  100 
 
 
163 aa  332  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  78.26 
 
 
162 aa  271  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  77.64 
 
 
162 aa  263  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  72.67 
 
 
162 aa  252  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  72.05 
 
 
162 aa  250  7e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  75.78 
 
 
162 aa  248  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  75.78 
 
 
162 aa  248  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  72.05 
 
 
162 aa  246  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  68.1 
 
 
163 aa  245  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  73.62 
 
 
163 aa  238  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  73.62 
 
 
163 aa  238  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  66.46 
 
 
162 aa  238  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  59.63 
 
 
162 aa  213  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  60.25 
 
 
162 aa  205  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  37.58 
 
 
155 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  37.58 
 
 
155 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  39.16 
 
 
164 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  36.36 
 
 
162 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  38.18 
 
 
164 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  33.54 
 
 
165 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  37.58 
 
 
164 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  37.95 
 
 
164 aa  97.8  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  33.94 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  35.76 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  33.54 
 
 
165 aa  87.4  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  33.94 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  29.38 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  28.3 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  28.3 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  27.04 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  28.75 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  29.88 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  26.88 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  27.04 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3741  Phycobilisome protein  28.4 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  28.12 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  27.16 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  26.88 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  29.73 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  26.25 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  26.25 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  26.25 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  28.83 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  25.48 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  24.38 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  25.48 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  24.69 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  26.95 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  28.4 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  31.86 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  26.54 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  26.92 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  26.54 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  30.51 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  27.5 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  27.16 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  27.5 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  27.16 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  26.71 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  27.88 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  27.27 
 
 
132 aa  57.4  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  30.97 
 
 
172 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  30.97 
 
 
172 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  23.53 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  29.2 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  26.81 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  26.81 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  28.32 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  30.09 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  28.07 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  28.32 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  26.35 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  21.6 
 
 
169 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  21.6 
 
 
169 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  30.09 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  28.57 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  33.33 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  28.33 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  28.45 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  26.67 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  32.63 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  29.26 
 
 
193 aa  48.5  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  25.54 
 
 
184 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  26.72 
 
 
169 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  25.89 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  22.79 
 
 
306 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  26.12 
 
 
179 aa  44.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  27.12 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  23.81 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  27.27 
 
 
184 aa  40.8  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  26.8 
 
 
192 aa  40.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>