71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_03301 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  94.12 
 
 		 170 aa  321  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  94.71 
 
 		 170 aa  320  5e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  81.03 
 
 		 175 aa  274  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  36.31 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  40.99 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  34.64 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  42.04 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  42.14 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  42.14 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  41.72 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  50 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  37.65 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  37.58 
 
 		 178 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  38.85 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  36.47 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  36.54 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  37.41 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  35.53 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  34.27 
 
 		 172 aa  87.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  36.05 
 
 		 173 aa  87  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  33.99 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  33.99 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  34.69 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  34.69 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  34.23 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  32.89 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  33.61 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  32.3 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  29.38 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  31.58 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  29.13 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  29.13 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  29.91 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  30.77 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  26.19 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  29.91 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  27.12 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  29.57 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  27.68 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  28.7 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  28.21 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  29.06 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  28.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  27.83 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  28.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  29.57 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  25.9 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  29 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  28 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  28.46 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  23.53 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  23.53 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  21.48 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  23.39 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  22.95 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  23.81 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  25.24 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  24.39 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  21.14 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  23.3 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  20.17 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  22.95 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  26.27 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  25 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  25 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  24.27 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  24.27 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  18.85 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  24 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  23.01 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>