108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0478 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  100 
 
 		 162 aa  326  7e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  98.77 
 
 		 162 aa  321  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  86.88 
 
 		 161 aa  288  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  86.25 
 
 		 161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  85 
 
 		 161 aa  280  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  84.38 
 
 		 161 aa  279  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  83.12 
 
 		 161 aa  278  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  84.38 
 
 		 161 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  84.38 
 
 		 161 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  83.02 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  53.61 
 
 		 169 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  60.74 
 
 		 169 aa  170  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  53.55 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  53.55 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  48.19 
 
 		 169 aa  160  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  46.75 
 
 		 174 aa  150  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  56.25 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  55.47 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  48.81 
 
 		 169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  41.67 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  41.38 
 
 		 179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  40.56 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  42.94 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  38.95 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  38.6 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  39.76 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  39.61 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  43.36 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  39.61 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  43.36 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  37.85 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  38.55 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  39.02 
 
 		 173 aa  117  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  40.49 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  40.49 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  41.55 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  37.35 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  38.22 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  50 
 
 		 184 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  35.67 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  36.6 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  37.34 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  37.42 
 
 		 177 aa  113  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  35.44 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  37.01 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  43.07 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  41.26 
 
 		 184 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  36.08 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  36.08 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  38.55 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  34.39 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  34.39 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  40.56 
 
 		 184 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  35.03 
 
 		 161 aa  107  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  35.44 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  33.76 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  38.32 
 
 		 172 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  36.05 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  35.44 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  36.81 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  34.81 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  39.23 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  32.91 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  32.28 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  28.75 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  30.91 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  28.22 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  26.75 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  29.57 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  29.27 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  28.12 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  30.37 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  28.7 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  24.36 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  30.91 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  29.09 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  28.66 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  27.98 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  29.09 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  25.77 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  33.54 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  33.54 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  27.68 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  24.69 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  27.5 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  28.48 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3741  Phycobilisome protein  27.74 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  27.48 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  28.24 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  23.93 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  26.43 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  26.22 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  27.81 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  23.31 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  23.31 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  23.93 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  26.83 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>