27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3741 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3741  Phycobilisome protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  29.63 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  28.05 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  27.61 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  28.4 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  29.27 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  28.83 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  29.88 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  25.77 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  29.88 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  30.25 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  30.25 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  27.61 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  27.1 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  25.81 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  27.1 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  27.74 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  25.81 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  23.17 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  27.1 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  26.45 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  24.52 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  24.52 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  21.34 
 
 		 162 aa  52  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  25.81 
 
 		 161 aa  52  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  22.42 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  23.65 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>