98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1894 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  100 
 
 		 165 aa  341  2e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  90.3 
 
 		 165 aa  314  4e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  62.8 
 
 		 162 aa  190  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  63.1 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  63.1 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  63.41 
 
 		 164 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  57.49 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  54.82 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  51.22 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  51.22 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  49.39 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  48.78 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  39.39 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  38.79 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  41.57 
 
 		 162 aa  117  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  37.58 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  39.16 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  39.39 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  35.76 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  37.95 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  38.79 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  33.54 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  36.14 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  36.14 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  35.98 
 
 		 163 aa  90.5  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  35.98 
 
 		 163 aa  90.5  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  29.52 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  29.52 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  28.92 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  30.4 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  30.4 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  25.15 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  27.54 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  26.51 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  25.9 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  25.3 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  28.57 
 
 		 306 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  28.06 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  28.8 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  29.6 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  27.86 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  28.57 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  27.38 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  24.1 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  24.1 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  26.81 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  27.86 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  23.08 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  26.21 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  28.4 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  26.21 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  24.1 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  27.81 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  26.95 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  26.95 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  23.49 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  26.4 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  25.71 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  26.43 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  32.03 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  28.57 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  25.53 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  25.53 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  26.81 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  27.07 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  25.71 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  28.68 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  28.57 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  25.53 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  25.53 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  25.56 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  25.56 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  26.24 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  26.19 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  27.86 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  30.16 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  27.86 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  24.65 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  24.85 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  24.14 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  24.65 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  25.55 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  25.38 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  30.77 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  25.95 
 
 		 193 aa  47.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  27.01 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  26.72 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  29.03 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  24.63 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  26.43 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0356  glutaredoxin  27.27 
 
 		 427 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.655994  normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  20 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  25.55 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  25.55 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  26.87 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  24.58 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  25.22 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  24.49 
 
 		 184 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>