98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0427 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  100 
 
 		 164 aa  337  5.9999999999999996e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  93.29 
 
 		 164 aa  298  2e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  68.9 
 
 		 164 aa  222  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  70.12 
 
 		 164 aa  217  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  69.51 
 
 		 164 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  63.41 
 
 		 155 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  57.93 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  59.76 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  55.42 
 
 		 165 aa  184  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  57.93 
 
 		 155 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  57.93 
 
 		 155 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  54.82 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  44.31 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  44.31 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  42.51 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  44.31 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  42.77 
 
 		 162 aa  127  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  40.96 
 
 		 162 aa  124  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  42.51 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  42.51 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  42.51 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  39.16 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  39.16 
 
 		 162 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  35.25 
 
 		 306 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  38.92 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  40.36 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  40.36 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  32.72 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  32.72 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  32.1 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  32.92 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  33.54 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  33.54 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  32.3 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  32.1 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  32.3 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  31.68 
 
 		 161 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  29.63 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  30.25 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  28.4 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  31.71 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  29.01 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  27.78 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  27.33 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  27.33 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  28.66 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  27.48 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  30.41 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  28.68 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  26.22 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  29.01 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  26.22 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  26.83 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  29.27 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  26.22 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  26.22 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  26.79 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  25 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  25.77 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  27.5 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  25.77 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  27.94 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  26.16 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  27.54 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  27.54 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  28.91 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  23.78 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  23.78 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  26.43 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  26.43 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  23.48 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  26.63 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  23.48 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  25.36 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  26.83 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  25.73 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  25.58 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  27.37 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  24.24 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  24.42 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  23.84 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  26.47 
 
 		 193 aa  50.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  23.76 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  20.99 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  21.74 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  25.19 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  28.7 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  25.19 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  25.19 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  26.06 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  26.02 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  25.71 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  25.73 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3741  Phycobilisome protein  23.49 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  25.76 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  22.35 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40218  predicted protein  48.65 
 
 		 402 aa  41.2  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>