84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5048 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  100 
 
 		 162 aa  333  5e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  77.16 
 
 		 162 aa  267  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  74.69 
 
 		 162 aa  263  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  74.07 
 
 		 162 aa  263  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  75.31 
 
 		 162 aa  254  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  72.05 
 
 		 163 aa  246  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  74.69 
 
 		 162 aa  246  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  74.69 
 
 		 162 aa  246  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  67.28 
 
 		 163 aa  240  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  64.81 
 
 		 162 aa  234  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  67.08 
 
 		 163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  67.08 
 
 		 163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  56.17 
 
 		 162 aa  202  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  56.79 
 
 		 162 aa  193  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  36.97 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  39.16 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  39.76 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  39.76 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  42.51 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  40.72 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  39.76 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  40.36 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  38.55 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  37.58 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  38.55 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  38.55 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  28.93 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  30 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  28.3 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  30 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  27.5 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  27.5 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  28.3 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  27.67 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  28.75 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  27.67 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  25.62 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  26.88 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  25.62 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  25 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  24.84 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  25.31 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  26.54 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  27.56 
 
 		 132 aa  62  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3741  Phycobilisome protein  27.61 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  23.27 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  23.9 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  27.88 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  29.09 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  27.88 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  24.64 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  28.05 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  28.48 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  28.57 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  27.88 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  26.67 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  26.67 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  29.2 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  26.67 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  28.21 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  22.63 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  33.33 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  27.35 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  30 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  25.64 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  25.64 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  27.43 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  25.64 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  25.64 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  27.12 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  26.5 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  24.79 
 
 		 172 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  24.79 
 
 		 172 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  25.64 
 
 		 172 aa  47.4  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  24.79 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  24.79 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  23.89 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  23.89 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  24.73 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  33.67 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  25.77 
 
 		 192 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  24.79 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  19.48 
 
 		 306 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  25.21 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>