110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1034 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  100 
 
 		 161 aa  330  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  79.5 
 
 		 161 aa  277  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  77.5 
 
 		 163 aa  270  8.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  77.64 
 
 		 161 aa  269  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  73.91 
 
 		 161 aa  259  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  73.91 
 
 		 161 aa  259  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  72.67 
 
 		 161 aa  257  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  82.58 
 
 		 132 aa  238  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  61.88 
 
 		 164 aa  225  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  60 
 
 		 164 aa  220  6e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  55.62 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  51.55 
 
 		 161 aa  190  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  54.04 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  51.88 
 
 		 161 aa  187  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  50 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  49.69 
 
 		 161 aa  180  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  51.25 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  51.88 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  51.88 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  47.83 
 
 		 161 aa  174  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  40.88 
 
 		 161 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  40.88 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  38.99 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  39.62 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  40.25 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  38.99 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  37.74 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  37.74 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  35.67 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  37.97 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  37.34 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  38 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  31.71 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  32.75 
 
 		 173 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  32.93 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  32.93 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  38.93 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  33.12 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  32.34 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  32.52 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  34.53 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  31.74 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  31.18 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  31.74 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  31.74 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  36.36 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  30.64 
 
 		 193 aa  95.5  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  31.21 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  34.57 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  30.73 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  31.98 
 
 		 177 aa  90.9  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  29.34 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  28.74 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  30.57 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  28.81 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  26.9 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  36.36 
 
 		 169 aa  87.4  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  35.83 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  28.49 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  27.93 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  26.7 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  27.27 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  27.27 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  28.48 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  33.33 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  31.29 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  29.38 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  31.71 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  30.33 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  30.86 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  26.82 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  31.48 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  29.03 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  28.75 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  27.5 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  26.88 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  28.75 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  28.4 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  30.06 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  25.62 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  29.01 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  26.88 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  25.62 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  27.5 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  27.5 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  28.75 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  28.75 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.7 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  25.62 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  28.57 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  29.6 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  24.69 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  22.37 
 
 		 702 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  23.46 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  23.46 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  25.62 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  26.36 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  21.48 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>