111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1838 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  77.51 
 
 		 169 aa  277  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  69.23 
 
 		 169 aa  249  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  69.23 
 
 		 169 aa  249  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  72.78 
 
 		 169 aa  243  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  66.86 
 
 		 169 aa  242  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  70.41 
 
 		 169 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  65.09 
 
 		 169 aa  216  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  54.97 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  54.97 
 
 		 174 aa  194  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  59.28 
 
 		 161 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  60.12 
 
 		 161 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  60.12 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  58.68 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  58.93 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  58.93 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  57.14 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  55.69 
 
 		 161 aa  177  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  53.61 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  53.61 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  44.25 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  51.13 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  47.1 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  47.1 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  47.62 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  43.23 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  50.38 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  46.41 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  46.41 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  45.81 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  42.58 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  44.85 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  48.15 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  52.21 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  43.51 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  42.11 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  41.67 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  39.49 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  41.67 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  42.86 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  43.38 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  42.65 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  43.38 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  40.25 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  42.65 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  41.98 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  39.02 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  42.22 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  43.38 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  50.45 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  37.8 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  49.09 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  48.65 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  37.42 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  39.31 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  40 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  36.84 
 
 		 172 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  38.17 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  38.93 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  38.17 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  38.06 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  36.77 
 
 		 164 aa  101  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  38.93 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  35.88 
 
 		 161 aa  99  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  45.71 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  35.88 
 
 		 161 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  35.88 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  32.82 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  27.82 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  30.66 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  29.71 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  26.5 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  29.71 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  27.74 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  29.01 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  26.79 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  27.54 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  27.68 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  31.11 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  27.54 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  26.83 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  26.09 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  26.79 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  30.37 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  26.92 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  24.64 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  25.81 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  30.07 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  28.89 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  28.47 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.82 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  24.6 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  27.73 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  37.08 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  37.08 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  27.41 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  27.41 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  27.41 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  26.81 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  26.81 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>