102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4515 on replicon NC_011723
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  100 
 
 		 164 aa  337  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  87.8 
 
 		 164 aa  280  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  86.59 
 
 		 164 aa  270  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  71.34 
 
 		 164 aa  221  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  70.12 
 
 		 164 aa  217  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  62.8 
 
 		 165 aa  204  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  64.63 
 
 		 162 aa  195  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  63.41 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  60.37 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  57.93 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  57.93 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  58.54 
 
 		 155 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  43.98 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  45.51 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  44.58 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  42.17 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  45.18 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  42.17 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  40.36 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  40.36 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  42.77 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  37.58 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  41.57 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  41.57 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  41.82 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  41.82 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  36.05 
 
 		 306 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  33.54 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  32.3 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  33.54 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  32.92 
 
 		 161 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  30.86 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  31.06 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  30.67 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  30.25 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  29.63 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  29.63 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  31.48 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  31.34 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  33.08 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  31.01 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  28.4 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  31.11 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  32.31 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  31.1 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  28.99 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  29.63 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  32.35 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  32.31 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  31.11 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  33.82 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  26.83 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  26.83 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  31.3 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  31.3 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  29.46 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  28.46 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  30.83 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  30.4 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  30.53 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  31.5 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  27.94 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  27.48 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  31.97 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  27.48 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  29.01 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  30.16 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  30.16 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  28.24 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  28.24 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  28.8 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  28.8 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  29.6 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  28.24 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  29.6 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  29.63 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  26.72 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  26.72 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  25.19 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  27.12 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  28 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  28.35 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  27.56 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  26.87 
 
 		 132 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  28.68 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  25.19 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  27.2 
 
 		 193 aa  51.2  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  25.19 
 
 		 182 aa  50.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  25.19 
 
 		 182 aa  50.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  30.17 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  27.2 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  30.1 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  30.1 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  26.43 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  24.81 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  28.16 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  23.12 
 
 		 192 aa  43.9  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  25 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0356  glutaredoxin  28.67 
 
 		 427 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.655994  normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  26.87 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>