82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1671 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  99.45 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  86.19 
 
 		 182 aa  325  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  78.45 
 
 		 181 aa  285  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  65.22 
 
 		 184 aa  239  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  65.22 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  64.09 
 
 		 177 aa  233  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  63.59 
 
 		 184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  62.98 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  61.33 
 
 		 178 aa  220  7e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  59.67 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  56.22 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  58.05 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  50.29 
 
 		 172 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  50 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  50 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  49.14 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  49.14 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  45.71 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  48.85 
 
 		 173 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  45.14 
 
 		 172 aa  154  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  47.7 
 
 		 173 aa  153  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  47.43 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  49.14 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  44 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  44 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  42.29 
 
 		 172 aa  137  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  40.91 
 
 		 175 aa  134  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  41.62 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  41.14 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  42.14 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  42.68 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  42.68 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  41.61 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  41.61 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  40.37 
 
 		 161 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  40.99 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  40.49 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  40.49 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  40.94 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  40.4 
 
 		 161 aa  114  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  40 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  40.74 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  40.74 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  40.74 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  37.78 
 
 		 169 aa  101  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  36.3 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  38.82 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  39.26 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  37.31 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  38.06 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  27.84 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  27.84 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  27.27 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  27.12 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  25.97 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  26.7 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  25.56 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  27.27 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  26.14 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  26.7 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  26.14 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  25.93 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  27.7 
 
 		 132 aa  72  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  24.44 
 
 		 161 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  24.69 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  27.12 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  24.86 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  24.86 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  28.67 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  25.36 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  21.51 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  27.69 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  22.31 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  25.93 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  25.19 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  24.82 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  25 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  26.13 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  26.67 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  24 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>