108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2158 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 169 aa  335  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  68.05 
 
 		 169 aa  251  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  68.67 
 
 		 169 aa  249  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  68.67 
 
 		 169 aa  249  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  66.86 
 
 		 169 aa  243  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  71.6 
 
 		 169 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  65.09 
 
 		 169 aa  233  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  68.67 
 
 		 169 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  54.97 
 
 		 174 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  54.39 
 
 		 174 aa  193  9e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  50.9 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  50.3 
 
 		 161 aa  164  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  51.5 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  50.3 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  51.5 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  54.55 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  54.17 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  50.3 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  50 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  49.4 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  45.93 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  45.59 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  45.59 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  41.61 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  39.6 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  44.12 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  43.57 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  43.97 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  43.97 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  44.03 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  47.01 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  39.6 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  42.25 
 
 		 178 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  40.97 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  44.44 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  41.91 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  42.96 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  43.61 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  38.82 
 
 		 181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  40.74 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  41.48 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  40.74 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  40.74 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  43.61 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  35.57 
 
 		 172 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  38.52 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  37.5 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  34.78 
 
 		 161 aa  101  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  36.96 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  34.06 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  31.85 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  36.36 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  36.36 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  37.12 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  37.82 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  37.82 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  37.01 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  37.01 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  34.67 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  33.33 
 
 		 161 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  35.88 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  36.36 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  35.88 
 
 		 164 aa  91.3  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  32.82 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  31.3 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  37.84 
 
 		 132 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  34.31 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  35.04 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  31.1 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  30.41 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  28.99 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  30.87 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  32.12 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  31.62 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  28.7 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  29.94 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  26.76 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  31.62 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  25.78 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  29.57 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  26.11 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  26.22 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  28.78 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  29.71 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  29.57 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  25.18 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  25.18 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  30.77 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  29.91 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  25.55 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  27.04 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  33.61 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  29.82 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  26.72 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  25.64 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  25.56 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  28.91 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  29.06 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  29.06 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>