105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1264 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  100 
 
 		 174 aa  347  5e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  87.36 
 
 		 174 aa  309  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  54.97 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  54.97 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  54.97 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  52.63 
 
 		 169 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  54.39 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  49.71 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  54.97 
 
 		 169 aa  177  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  54.39 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  50.6 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  48.8 
 
 		 161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  47.34 
 
 		 162 aa  151  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  46.75 
 
 		 162 aa  150  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  49.4 
 
 		 161 aa  150  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  52.86 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  49.4 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  49.4 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  51.8 
 
 		 162 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  47.59 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  41.18 
 
 		 172 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  45.53 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  45.53 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  37.87 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  43.28 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  41.86 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  43.9 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  42.15 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  43.9 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  44.63 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  44.63 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  41.04 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  43.9 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  37.24 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  37.24 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  41.54 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  41.94 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  37.69 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  40.8 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  39.34 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  41.44 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  38.06 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  37.31 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  36.67 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  36.67 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  35.71 
 
 		 161 aa  96.7  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  40.37 
 
 		 177 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  37.31 
 
 		 182 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  37.31 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  38.64 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  35.71 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  38.52 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  33.85 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  32.26 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  38.74 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  38.14 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  38.14 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  33.33 
 
 		 172 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  34.67 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  32.67 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  35.83 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  36.52 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  29.8 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  33.91 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  35.1 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  34.75 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  39.62 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  26.63 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  27.27 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  25.56 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  27 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  25.86 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  28 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  23.53 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  28 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  27.48 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  28.24 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  29.2 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  23.48 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  32.43 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4420  Phycobilisome protein  26.36 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  26.12 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  25.77 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  25.64 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  25.18 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  20.9 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  20.9 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  23.93 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  23.08 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  24.24 
 
 		 306 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  22.58 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  21.64 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  25.64 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  25.56 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  36.99 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  36.99 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  23.39 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  22.13 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  53.12 
 
 		 1100 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  56.25 
 
 		 705 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>