89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5726 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  100 
 
 		 194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  63.04 
 
 		 194 aa  250  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  59.57 
 
 		 192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  40.98 
 
 		 195 aa  154  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  35.68 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  33.33 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  28 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  31.37 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  32.45 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  31.61 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  31.37 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  31.79 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  31.65 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  29.25 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  28.67 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  29.73 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  27.74 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  30.13 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  29.61 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  27.81 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  27.81 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  29.22 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  28.57 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  30.32 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  29.03 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  28.48 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  25.66 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  26.32 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  27.82 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  25.81 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  24.38 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  31.2 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  26.45 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  24.81 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  27.07 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  23.23 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  23.23 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  25.16 
 
 		 161 aa  62  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  23.23 
 
 		 161 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  24.38 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  23.9 
 
 		 173 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  24.36 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  23.9 
 
 		 173 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  36.46 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  36.08 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  24.36 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  29.03 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  24.69 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  24.69 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  24.38 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  24.38 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  27.13 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  25.16 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  25.81 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  34.38 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  34.38 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  24.22 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  26.09 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  23.31 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  25 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  23.48 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  24.24 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  22.89 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  27.1 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  33.33 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  29.2 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.68 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  31.25 
 
 		 162 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  21.8 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  23.28 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  22.73 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  20.36 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  29.17 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  21.9 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  25.56 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  21.51 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  25.89 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  21.51 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  34.02 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  23.53 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  24.18 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  23.01 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  25.3 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  23.01 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  31.58 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  31.58 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  25.38 
 
 		 165 aa  42  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  27.27 
 
 		 162 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>