113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4994 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  100 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  85.71 
 
 		 161 aa  294  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  83.75 
 
 		 161 aa  283  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  85 
 
 		 161 aa  282  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  80.75 
 
 		 161 aa  271  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  80.12 
 
 		 161 aa  270  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  80.12 
 
 		 161 aa  270  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  79.38 
 
 		 161 aa  267  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  76.25 
 
 		 161 aa  266  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  75 
 
 		 161 aa  261  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  55.62 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  55 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  56.25 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  56.25 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  54.37 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  55 
 
 		 161 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  52.8 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  48.45 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  46.58 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  53.91 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  37.58 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  43.51 
 
 		 169 aa  120  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  37.58 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  40.62 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  39.22 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  38.12 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  38.12 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  37.91 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  40.29 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  36.31 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  36.31 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  40.29 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  37.91 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  38.75 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  43.51 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  38.22 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  36.59 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  35.37 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  35.67 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  35.67 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  34.15 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  39.42 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  39.42 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  38.1 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  36.02 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  35 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  35.62 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  34.76 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  36.88 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  39.57 
 
 		 169 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  32.2 
 
 		 193 aa  98.2  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  30.51 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  38.64 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  33.58 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  29.21 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  34 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  28.96 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  28.42 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  29.55 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  32.35 
 
 		 174 aa  87.4  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  29.56 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  33.33 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  27.62 
 
 		 182 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  32.3 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  31.68 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  30.17 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  27.22 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  27.32 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  29.14 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  32.3 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  28.48 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  30.19 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  29.56 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  26.67 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  31.48 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  28.93 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  25.41 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  28.57 
 
 		 194 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  25.97 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  29.56 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  28.93 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  30.86 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  28.3 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  27.04 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  31.25 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  31.25 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  29.81 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  29.56 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  29.56 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  26.82 
 
 		 702 aa  68.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  30.25 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.1 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  25.47 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  26.51 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  25.47 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  29.13 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  28.91 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  30.08 
 
 		 913 aa  57.4  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  24.81 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>