80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1672 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  100 
 
 
155 aa  322  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  100 
 
 
155 aa  322  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  80.65 
 
 
155 aa  263  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  64.52 
 
 
155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  57.93 
 
 
164 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  57.93 
 
 
164 aa  164  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  57.93 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  56.71 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  57.93 
 
 
164 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  51.83 
 
 
165 aa  156  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  51.85 
 
 
162 aa  146  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  50.91 
 
 
165 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  42.42 
 
 
162 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  42.42 
 
 
162 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  41.57 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  41.57 
 
 
162 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  39.76 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  40.36 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  40.12 
 
 
162 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  39.76 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  37.58 
 
 
163 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  40.12 
 
 
162 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  39.16 
 
 
162 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  39.16 
 
 
162 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  37.58 
 
 
163 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  37.58 
 
 
163 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  31.9 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  31.9 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  26.09 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  25.47 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  27.16 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  24.07 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  25.93 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  26.12 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  26.12 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  26.54 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  26.38 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  27.16 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  25.31 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  27.27 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  27.34 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  25.31 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  26.52 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  25.45 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  23.93 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  23.93 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  23.46 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  23.46 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  25 
 
 
169 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  25.18 
 
 
169 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  23.46 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  23.93 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  23.31 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  23.31 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  27.41 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  27.63 
 
 
306 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  23.93 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  24.46 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  24.46 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  23.31 
 
 
162 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  23.88 
 
 
164 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  28.66 
 
 
179 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  22.7 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  24.03 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  20.9 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  23.81 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  19.4 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  25.22 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  22.15 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  27.17 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  25.77 
 
 
192 aa  43.9  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  24.55 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  25.22 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  25.22 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  23.24 
 
 
173 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  25.22 
 
 
172 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  23.31 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  23.31 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  26.09 
 
 
172 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  23.48 
 
 
172 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.743765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>