106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1908 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 172 aa  343  8.999999999999999e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  89.53 
 
 		 172 aa  317  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  76.16 
 
 		 172 aa  278  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  76.16 
 
 		 172 aa  278  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  76.74 
 
 		 172 aa  276  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  74.42 
 
 		 172 aa  274  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  74.27 
 
 		 173 aa  270  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  74.27 
 
 		 173 aa  270  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  72.67 
 
 		 172 aa  261  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  71.18 
 
 		 173 aa  256  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  70.18 
 
 		 173 aa  255  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  67.44 
 
 		 173 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  62.21 
 
 		 172 aa  227  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  61.99 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  50 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  50.88 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  47.49 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  49.13 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  45.65 
 
 		 184 aa  167  9e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  45.11 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  45.11 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  44.89 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  47.22 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  45.14 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  45.14 
 
 		 182 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  43.09 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  45.19 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  41.72 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  43.06 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  43.06 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  42.58 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  40.36 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  38.55 
 
 		 161 aa  121  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  43.28 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  38.03 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  39.6 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  39.16 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  41.67 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  38.75 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  42.96 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  37.2 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  37.35 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  38.55 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  38.55 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  37.35 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  36.75 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  36.75 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  37.5 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  36.88 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  36.88 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  35.98 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  34.76 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  33.12 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  38.12 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  36.88 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  38.12 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  34.53 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  34.81 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  34.53 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  34.78 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  33.81 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  33.81 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  32.37 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  31.03 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  34.78 
 
 		 163 aa  94.4  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  33.75 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  33.11 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  33.57 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  34.23 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  32.82 
 
 		 132 aa  84.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  24.38 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  27.06 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  30.77 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  21.76 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  29.91 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  25 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  27.94 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  32.5 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  27.06 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  23.87 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  29.06 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  25.36 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  26.5 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  28.32 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  25.36 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  26.95 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  25 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  23.36 
 
 		 155 aa  50.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  24.24 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  27.35 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  25.89 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  25.21 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  30.09 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  30.09 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  25.64 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  22.34 
 
 		 1100 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  23.81 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  23.81 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>