113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2930 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 173 aa  350  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  86.63 
 
 		 173 aa  306  8e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  81.18 
 
 		 172 aa  288  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  79.07 
 
 		 173 aa  285  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  79.07 
 
 		 173 aa  285  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  77.65 
 
 		 172 aa  278  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  75 
 
 		 173 aa  276  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  77.65 
 
 		 172 aa  273  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  77.65 
 
 		 172 aa  273  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  76.47 
 
 		 172 aa  273  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  71.18 
 
 		 172 aa  256  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  67.65 
 
 		 172 aa  249  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  68.24 
 
 		 172 aa  247  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  64.12 
 
 		 172 aa  237  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  56.57 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  53.41 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  53.76 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  50.57 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  51.65 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  50.85 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  51.1 
 
 		 184 aa  174  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  53.85 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  51.4 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  50 
 
 		 181 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  47.43 
 
 		 182 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  48.85 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  48.85 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  48.98 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  46.27 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  47.62 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  47.01 
 
 		 169 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  47.01 
 
 		 169 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  47.62 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  40.24 
 
 		 161 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  38.6 
 
 		 162 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  40.24 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  39.63 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  44.08 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  38.6 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  44.03 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  39.63 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  39.63 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  42.15 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  34.12 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  43.48 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  36.59 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  42.96 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  35.09 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  34.71 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  33.53 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  34.71 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  33.54 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  33.54 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  33.53 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  33.53 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  33.53 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  34.71 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  35.37 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  31.71 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  35.66 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  34.29 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  33.33 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  31.71 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  31.1 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  33.33 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  35.62 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  33.33 
 
 		 132 aa  90.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  35.53 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  34.64 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  33.33 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  34.51 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  26.88 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  29.73 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  27.1 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  33.33 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  28.67 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  24.81 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  24.39 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  27.16 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  26.79 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  29.91 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  30.83 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  27.97 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  27.97 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  25.89 
 
 		 1100 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  27.84 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.82 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  33.05 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  33.05 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  24.07 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  29.2 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  24.63 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  26.12 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  26.81 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  40.62 
 
 		 705 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  26.57 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  26.57 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  29.17 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  29.17 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>