92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0984 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  100 
 
 
179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  76.11 
 
 
193 aa  266  8e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  74.86 
 
 
178 aa  265  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  72.07 
 
 
177 aa  249  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  67.44 
 
 
179 aa  229  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  65.59 
 
 
184 aa  227  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  63.44 
 
 
184 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  61.83 
 
 
184 aa  219  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  59.89 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  59.67 
 
 
182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  59.12 
 
 
182 aa  210  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  58.01 
 
 
181 aa  207  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  58.06 
 
 
184 aa  205  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  50.84 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  50.84 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  50.28 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  51.96 
 
 
172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  49.44 
 
 
173 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  51.12 
 
 
173 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  49.44 
 
 
173 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  48.6 
 
 
172 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  50.85 
 
 
173 aa  174  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  47.49 
 
 
172 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  49.16 
 
 
172 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  48.04 
 
 
173 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  42.46 
 
 
172 aa  151  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  43.82 
 
 
172 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  42.46 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  40.78 
 
 
161 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  40.78 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  40.78 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  47.14 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  40.22 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  41.95 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  41.38 
 
 
162 aa  127  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  40.78 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  44.85 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  44.37 
 
 
169 aa  125  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  43.66 
 
 
161 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  45.93 
 
 
169 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  42.96 
 
 
169 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  37.87 
 
 
174 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  43.7 
 
 
169 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  43.7 
 
 
169 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  40.26 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  36.69 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  38.82 
 
 
170 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  44.44 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  43.06 
 
 
169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  36.54 
 
 
170 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  35.84 
 
 
170 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  31.61 
 
 
161 aa  96.7  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  29.21 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  32.18 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  30.06 
 
 
161 aa  91.3  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  29.89 
 
 
161 aa  91.3  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  28.74 
 
 
161 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  28.74 
 
 
161 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  30.46 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  30.46 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  30.46 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  29.89 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  28.74 
 
 
161 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  27.59 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  31.65 
 
 
163 aa  85.1  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  30 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  28.65 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  27.01 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  29.41 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  30.43 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  28.77 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  26.09 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  32.8 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  21.89 
 
 
194 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  24.4 
 
 
192 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  28.35 
 
 
164 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  24.82 
 
 
162 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  28.21 
 
 
162 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  26.79 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  28.42 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  27.35 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  30.37 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  28.24 
 
 
164 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  24.8 
 
 
190 aa  44.7  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  28.03 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  26.12 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  26.09 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  25.14 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  25.19 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  28.46 
 
 
155 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  27.91 
 
 
164 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  26.67 
 
 
195 aa  41.6  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>