108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2925 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  100 
 
 		 172 aa  346  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  81.29 
 
 		 172 aa  292  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  68.24 
 
 		 173 aa  247  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  64.33 
 
 		 172 aa  236  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  65.29 
 
 		 173 aa  233  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  63.74 
 
 		 172 aa  232  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  63.74 
 
 		 173 aa  231  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  64.33 
 
 		 172 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  63.74 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  63.74 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  63.53 
 
 		 173 aa  226  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  63.53 
 
 		 173 aa  226  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  61.99 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  59.65 
 
 		 172 aa  220  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  49.43 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  45.9 
 
 		 184 aa  160  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  49.18 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  46.33 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  46.99 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  45.36 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  44.07 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  42.7 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  43.82 
 
 		 179 aa  151  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  45.86 
 
 		 182 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  46.11 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  44 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  44 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  36.63 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  37.42 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  34.88 
 
 		 161 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  38.52 
 
 		 169 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  34.88 
 
 		 161 aa  105  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  34.76 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  35.33 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  36.05 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  35.47 
 
 		 162 aa  104  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  36.05 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  34.86 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  37.33 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  35.17 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  35.17 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  33.93 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  37.5 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  33.73 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  31.18 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  34.38 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  33.72 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  33.72 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  35.53 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  35.8 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  35.8 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  31.87 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  29.41 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  35.57 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  36.03 
 
 		 169 aa  94.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  34.78 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  29.24 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  32.47 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  35.29 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  32.08 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  33.33 
 
 		 174 aa  91.7  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  32.61 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  31.1 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  31.1 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  28.05 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  28.78 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  32.12 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  32.08 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  32.3 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  31.29 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  31.78 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  25.44 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  32.48 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  27.07 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  31.62 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  28.46 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  26.67 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  29.91 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  26.25 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  24.56 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  28.57 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  23.46 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  31.62 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  29.06 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  31.62 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  28.32 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  25.73 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  28.21 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  24.39 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  23.98 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  23.53 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  24.39 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  22.7 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  30.97 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  30.97 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  24.79 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.66 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  21.17 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  24.37 
 
 		 1100 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  24.21 
 
 		 1130 aa  45.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>