67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4811 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  37.61 
 
 		 164 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  37.61 
 
 		 164 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  38.98 
 
 		 164 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  36.75 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  40.68 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  34.43 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1183  hypothetical protein  31.54 
 
 		 149 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  28 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  29.91 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  26.62 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  29.13 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  26.83 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  23.57 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  24.39 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  29.32 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  29.22 
 
 		 162 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  34.48 
 
 		 155 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  29.41 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  30.4 
 
 		 139 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  23.72 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  30.43 
 
 		 144 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  27.63 
 
 		 155 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  27.63 
 
 		 155 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  24.36 
 
 		 161 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  25.62 
 
 		 161 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  22.93 
 
 		 161 aa  52.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  25.62 
 
 		 161 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  25 
 
 		 161 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  23.81 
 
 		 136 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  21.79 
 
 		 161 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  20.65 
 
 		 161 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  20.65 
 
 		 161 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  25.93 
 
 		 162 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  22.78 
 
 		 161 aa  49.7  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  22.78 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  28.7 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  30.17 
 
 		 162 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  21.79 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  23.81 
 
 		 173 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  29.93 
 
 		 140 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  30.09 
 
 		 169 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  24.24 
 
 		 174 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  27.03 
 
 		 161 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  27.03 
 
 		 161 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  24 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  27.03 
 
 		 162 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  24.6 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  24.18 
 
 		 173 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  22.86 
 
 		 174 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  22.79 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  23.81 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  26.23 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  26.23 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  25.2 
 
 		 141 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  24.44 
 
 		 162 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  26.24 
 
 		 161 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  25.68 
 
 		 161 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  23.68 
 
 		 169 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  23.68 
 
 		 169 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  23.53 
 
 		 173 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  23.53 
 
 		 173 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  27.55 
 
 		 169 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>