25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0698 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  275  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  33.09 
 
 
141 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  33.83 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  34.07 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  43.28 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  33.58 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  35.82 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  34.33 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  34.07 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  30.6 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  29.55 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  31.67 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  29.71 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  31.5 
 
 
306 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  25 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  24.81 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  28.81 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  20.3 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  28.06 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0957  hypothetical protein  34.62 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000165315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>