23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2306 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  100 
 
 
133 aa  273  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  44.62 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  36.64 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  36.92 
 
 
141 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  34.85 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  33.83 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  32.82 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  27.48 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  34.62 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  31.75 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  29.23 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  26.32 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  26.92 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  26.92 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  29.55 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  29.85 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  25.95 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  31.5 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  26.09 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  29.37 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>