24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2686 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  100 
 
 
151 aa  315  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  43.62 
 
 
154 aa  146  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  40.4 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  33.56 
 
 
153 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  31.54 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  30.94 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  31.34 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  31.72 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  30.34 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  26.95 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  28.91 
 
 
306 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  28.46 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  26.09 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  24.81 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  19.73 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  25 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  27.56 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  26.24 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  23.13 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  24.65 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  27.78 
 
 
149 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  24.79 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  24.26 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>