27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5555 on replicon NC_011730
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  37.4 
 
 
137 aa  103  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  38.14 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  38.84 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  35.25 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  32.61 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  33.07 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  34.11 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  33.09 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  26.4 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  29.77 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  33.33 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  26.09 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  31.06 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  34.19 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  29.77 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  26.95 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  32.52 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  28.68 
 
 
306 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  30.36 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  28.68 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  31.68 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1183  hypothetical protein  26.02 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3456  PilT protein domain protein  26.72 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635696 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0266  hypothetical protein  24.52 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.041266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>