16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3456 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3456  PilT protein domain protein  100 
 
 
144 aa  290  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635696 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3282  hypothetical protein  45.14 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0656085  normal  0.0348578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3292  PilT protein-like  32.74 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2348  PilT domain-containing protein  31.86 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.395155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0824  PilT protein-like protein  33.63 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0841  PilT domain-containing protein  33.63 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2564  PilT protein-like  30.36 
 
 
133 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12615  hypothetical protein  29.17 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000162145  normal  0.753515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  29.27 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0846  PilT domain-containing protein  31.86 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408442  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  26.72 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10610  hypothetical protein  32.94 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.284141  normal  0.980578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  26.32 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  22.48 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  22.76 
 
 
144 aa  40  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>