30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0366 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  39.86 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  40.4 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  38.3 
 
 
141 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  36.24 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  36.88 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  35.25 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  34.69 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  36.36 
 
 
141 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  31.21 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  35.57 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  30.53 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  33.08 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  31.76 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  30.3 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  32.37 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  29.01 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  20.77 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  25.49 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  27.34 
 
 
153 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0334  PilT protein-like  27.56 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184149  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0022  hypothetical protein  32.41 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.952078 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5277  hypothetical protein  32.41 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2771  hypothetical protein  24.68 
 
 
165 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3456  PilT protein domain protein  22.48 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  25 
 
 
306 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>