12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2348 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2348  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  260  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.395155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3292  PilT protein-like  82.96 
 
 		 135 aa  222  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2564  PilT protein-like  83.87 
 
 		 133 aa  202  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0824  PilT protein-like protein  62.12 
 
 		 144 aa  141  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0841  PilT domain-containing protein  62.12 
 
 		 144 aa  141  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0846  PilT domain-containing protein  60.61 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10610  hypothetical protein  60.9 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.284141  normal  0.980578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12615  hypothetical protein  38.35 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000162145  normal  0.753515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3456  PilT protein domain protein  31.86 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635696 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3282  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0656085  normal  0.0348578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2198  hypothetical protein  47.5 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.588045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12450  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>