21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1184 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  100 
 
 
148 aa  302  9.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  40.15 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  35.57 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  32.89 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  29.93 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  27.34 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  33.57 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  33.77 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  28.24 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  31.39 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  25 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  27.97 
 
 
133 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  29.66 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  25.55 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  29.41 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  36.27 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  28.68 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0266  hypothetical protein  25.32 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.041266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  27.27 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  24.26 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>