27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0099 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  100 
 
 		 148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  37.58 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  31.54 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  36.24 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  33.83 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  34.62 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  34.07 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  29.73 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  34.81 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  28.79 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  31.16 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  31.85 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  32.89 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  32.58 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  27.78 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  29.03 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  32.38 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0439  hypothetical protein  32.91 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0266  hypothetical protein  24.36 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.041266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  23.29 
 
 		 149 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>