14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0978 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  100 
 
 
105 aa  208  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  31.07 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  28.87 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  32.38 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  31.43 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  29.7 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  30 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  31.37 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  36.27 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  31.68 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  27.45 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0439  hypothetical protein  32.14 
 
 
84 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>