21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1173 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  310  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  32.52 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  30.5 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  27.14 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  32.87 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  29.41 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  25.83 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  25.49 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  28 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  26.17 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  26.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  28.06 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  24.09 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  25.19 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  22.79 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  24.26 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 151 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  24.09 
 
 		 306 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  23.29 
 
 		 148 aa  40  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.24947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>