27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0887 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  275  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  57.14 
 
 		 140 aa  156  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  34.33 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  37.12 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  32.31 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  32.33 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  26.09 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  32.58 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  27.21 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  26.45 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  22.38 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  28.24 
 
 		 148 aa  57  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  30.4 
 
 		 306 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  27.64 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  32.85 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  25 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  26.24 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  25.83 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  29.06 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  31.37 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  31.4 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  24.05 
 
 		 155 aa  43.5  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  27.27 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>