25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2141 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  100 
 
 
154 aa  312  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  54.25 
 
 
154 aa  186  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  43.62 
 
 
151 aa  146  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  38 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  36.24 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  36.24 
 
 
148 aa  87  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  33.58 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  33.83 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  31.06 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  31.16 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  30.22 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  33.77 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  27.7 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  31.11 
 
 
135 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  26.87 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  27.27 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  27.14 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  25 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  22.06 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  29.69 
 
 
153 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  25.19 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0266  hypothetical protein  27.74 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.041266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  23.26 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>