26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0123 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  100 
 
 
141 aa  286  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  38.3 
 
 
147 aa  100  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  38.24 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  34.07 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  40.15 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 
137 aa  87  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  34.33 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  35.16 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  32.61 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  34.85 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  31.58 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  34.07 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  29.01 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  31.72 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  28.79 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  29.41 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  28.67 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  30.22 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  29.31 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  24.81 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0266  hypothetical protein  24.84 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.041266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  25.2 
 
 
306 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0439  hypothetical protein  33.77 
 
 
84 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>