27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2577 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  275  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  37.4 
 
 
141 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  32.59 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  33.58 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  31.3 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  30.83 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  37.31 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  28.79 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  29.41 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  27.35 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  30.83 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  29.13 
 
 
306 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  26.87 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  27.14 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  31.4 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  26.09 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0439  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  25.55 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  20.29 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  23.93 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  27.45 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0957  hypothetical protein  25.9 
 
 
139 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000165315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>