27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0236 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  100 
 
 
136 aa  274  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  39.57 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  32.35 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  37.12 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  31.58 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  33.82 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  31.62 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  31.16 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  33.6 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  32.37 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  29.71 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  32.59 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  30.34 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  31.16 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  33.58 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  30.5 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  30.5 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  31.16 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  23.81 
 
 
306 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a036  PIN domain protein  35.11 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00103268  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  30 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0957  hypothetical protein  31.58 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000165315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  23.36 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>