26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4420 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4420  Phycobilisome protein  100 
 
 		 154 aa  320  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0678  Phycobilisome protein  40.26 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3168  Phycobilisome protein  39.6 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1087  Phycobilisome protein  34.44 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1058  Phycobilisome protein  34.44 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1090  hypothetical protein  32.67 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.548026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  26.17 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  26.17 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  23.31 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  26.4 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  26.36 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  22.22 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  22.67 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  24.55 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  21.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  21.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  24.8 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  25.62 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  21.02 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  24 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  24.8 
 
 		 169 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  23.12 
 
 		 169 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  25.22 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  26.32 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  23.2 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  23.2 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>