76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0165 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0165  Multidrug resistance efflux pump-like protein  100 
 
 		 366 aa  724    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0507  hypothetical protein  26.15 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0421  hypothetical protein  26.63 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3534  hypothetical protein  26.63 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0449  hypothetical protein  25.64 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4178  hypothetical protein  23.9 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000616  hypothetical protein  24.32 
 
 		 345 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.643039  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0688  hypothetical protein  22.89 
 
 		 348 aa  96.3  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0733  Multidrug resistance efflux pump-like protein  25.97 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0676  hypothetical protein  20.97 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00398993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  29.29 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  26.75 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  27.27 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.11 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  25.23 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  29.8 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.14 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  29.14 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  26.34 
 
 		 302 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 323 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  26.24 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  22.81 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  22.69 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  25.99 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  25 
 
 		 354 aa  49.7  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  28.28 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  28.28 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  23.79 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  22.81 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  23.79 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1965  putative membrane fusion protein family member  28.14 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  22.43 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0618  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  24.58 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.99 
 
 		 419 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  23.9 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  27.41 
 
 		 421 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.15 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  24.44 
 
 		 316 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  23.19 
 
 		 331 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  23.38 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  26.94 
 
 		 498 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  24.17 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  28.51 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.78 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  21.88 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  28.51 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  28.86 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  28.51 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  29.6 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  29.6 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  29.6 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  26.14 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  28.57 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  22.61 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  22.45 
 
 		 417 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 416 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  27.23 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  21.93 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  28.57 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  21.93 
 
 		 287 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1133  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.87 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0793831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  21.96 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  25.96 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  25.57 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.84 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  21.93 
 
 		 287 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  30.61 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  26.24 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>